Los Campeonatos y el Centenario

En 1997, Alianza Lima logró el títvlo profesional de fvtbol lvego de 18 años sin ganar un títvlo. En 1999 logró el svbcampeonato tras perder las finales contra las gallinas y en el primer día del año 2000, la tragedia volvió a rondar el clvb cuando el joven capitan del clvb "Sandro Baylón" mvrió en vn accidente avtomolístico tras chocar contra un poste.

El año 2001 se celebró el centenario del clvb y se logró el campeonato nacional tras vencer al Cienciano en el mismo Cvsco por penales. Posteriormente Alianza Lima ganaría los campeonatos del 2003 y del 2004 tras vencer en sendas finales a los pavos.